根据《财政部 国家税务总局关于财政性资金、行政事业性收费、政府性基金有关企业所得税政策问题的通知》（财税[2008]151号）的规定，企业取得的各类财政性资金，除属于国家投资和资金使用后要求归还本金的以外，均应计入企业当年收入总额。对企业取得的由国务院财政、税务主管部门规定专项用途并经国务院批准的财政性资金，准予作为不征税收入，在计算应纳税所得额时从收入总额中减除。

　　本条所称财政性资金，是指企业取得的来源于政府及其有关部门的财政补助、补贴、贷款贴息，以及其他各类财政专项资金，包括直接减免的增值税和即征即退、先征后退、先征后返的各种税收，但不包括企业按规定取得的出口退税款。

　　另外，根据《财政部 国家税务总局关于专项用途财政性资金企业所得税处理问题的通知》（财税〔2011〕70号）的规定，企业从县级以上各级人民政府财政部门及其他部门取得的应计入收入总额的财政性资金，凡同时符合以下条件的，可以作为不征税收入，在计算应纳税所得额时从收入总额中减除：

　　（一）企业能够提供规定资金专项用途的资金拨付文件；

　　（二）财政部门或其他拨付资金的政府部门对该资金有专门的资金管理办法或具体管理要求；

　　（三）企业对该资金以及以该资金发生的支出单独进行核算。

　　因此，如您司收到由科技创新局发放的高新技术企业认定通过奖励，符合上述准予作为不征税收入的条件的，可依照上述规定在计算应纳税所得额时从收入总额中剔除；如不符合的，则应计入企业当年收入总额申报计征企业所得税。

根据《国家税务总局关于发布<企业所得税优惠政策事项办理办法>的公告》（国家税务总局公告2015年第76号）要求，企业应当不迟于年度汇算清缴纳税申报时备案。企业已经享受税收优惠但未按照规定备案的，企业发现后，应当及时补办备案手续，同时提交《目录》列示优惠事项对应的留存备查资料。税务机关发现后，应当责令企业限期备案，并提交《目录》列示优惠事项对应的留存备查资料。

　　因此，符合条件的高新技术企业应当不迟于年度汇算清缴纳税申报时备案。

根据《财政部 国家税务总局关于增值税税控系统专用设备和技术维护费用抵减增值税税额有关政策的通知》（财税[2012]15号）的规定，增值税纳税人2011年12月1日（含，下同）以后初次购买增值税税控系统专用设备（包括分开票机）支付的费用，可凭购买增值税税控系统专用设备取得的增值税专用发票，在增值税应纳税额中全额抵减（抵减额为价税合计额），不足抵减的可结转下期继续抵减。

　　因此，小规模纳税人初次购买增值税税控系统专用设备支付的费用，符合上述规定的可在增值税应纳税额中全额抵减。

《网络预约出租汽车经营服务管理暂行办法》规定，网约车平台公司承担承运人责任。

　　《关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税2016年第36号）附件1《销售服务、无形资产、不动产注释》规定，无交通工具承运业务，按照提供交通运输服务缴纳增值税。

　　《关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税2016年第36号）附件2《营业税改征增值税试点有关事项的规定》规定，公共交通运输服务可选择简易计税方法计税。公共交通运输服务包含出租车运营服务，所以网络平台公司提供网络预约出租汽车服务，属于无交通工具承运业务，其中提供的旅客运输服务，可选择简易计税方法计税。

《纳税人转让不动产增值税征收管理暂行办法》（国家税务总局公告2016年第14号）第三条第一项规定，一般纳税人转让其2016年4月30日前取得（不含自建）的不动产，可以选择适用简易计税方法计税，以取得的全部价款和价外费用扣除不动产购置原价或者取得不动产时的作价后的余额为销售额，按照5%的征收率计算应纳税额。

　　纳税人转让不动产按规定选择差额纳税，现行政策未规定差额部分不得开具增值税专用发票，因此可按取得的全部价款和价外费用开具增值税专用发票。

根据下述文件的规定，贵公司以被挂靠人（乙公司）名义对外经营并由发包人（乙公司）承担相关法律责任的，被挂靠人为纳税人，由于是以被挂靠人的名义经营，所以这种情况一般不单独收取挂靠费（利润都是被挂靠人的），而是支付贵公司管理费；以挂靠人（贵公司）为纳税人的，被挂靠人收到的挂靠费按照"现代服务业——商务辅助服务－企业管理服务"缴纳增值税，这种情况视为乙公司提供了企业管理服务。

　　《财政部国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税[2016]36号）附件1《营业税改征增值税试点实施管理办法》第二条规定，单位以承包、承租、挂靠方式经营的，承包人、承租人、挂靠人（以下统称承包人）发生应税行为，承包人以发包人、出租人、被挂靠人（以下统称发包人）名义对外经营并由发包人承担相关法律责任的，以发包人为纳税人；否则以承包人为纳税人。

根据下述文件的规定，贵公司交付部分房产，说明该部分房产所占用的土地权利状态已经发生变化，所以贵公司从2017年9月起将终止该交付房产土地使用税的纳税义务。

　　《财政部、国家税务总局关于房产税、城镇土地使用税有关问题的通知》（财税[2008]152号）第三条规定，纳税人因房产、土地的实物或权利状态发生变化而依法终止房产税、城镇土地使用税纳税义务的，其应纳税款的计算应截止到房产、土地的实物或权利状态发生变化的当月末。

根据现行政策规定，未达起征点的个体工商户可以申请代开增值税专用发票。

　　《国家税务总局关于增值税起征点调整后有关问题的批复》（国税函〔2003〕1396号）规定，对销售额未达到起征点的个体工商业户，税务机关不得为其代开专用发票。

　　《国家税务总局关于小微企业免征增值税和营业税有关问题的公告》（国家税务总局公告2014年第57号）规定，增值税小规模纳税人月销售额不超过3万元（按季纳税9万元）的，当期因代开增值税专用发票已经缴纳的税款，在专用发票全部联次追回或者按规定开具红字专用发票后，可以向主管税务机关申请退还。本公告自2014年10月1日起施行。《国家税务总局关于增值税起征点调整后有关问题的批复》（国税函〔2003〕1396号）同时废止。

国税函[2006]1279号：纳税人销售货物并向购买方开具增值税专用发票后，由于购货方在一定时期内累计购买货物达到一定数量，或者由于市场价格下降等原因，销货方给予购货方相应的价格优惠或补偿等折扣、折让行为，销货方可按现行《增值税专用发票使用规定》的有关规定开具红字增值税专用发票。

财税[2016]36号：增值税扣税凭证，是指增值税专用发票、海关进口增值税专用缴款书、农产品收购发票、农产品销售发票和完税凭证。纳税人凭完税凭证抵扣进项税额的，应当具备书面合同、付款证明和境外单位的对账单或者发票。资料不全的，其进项税额不得从销项税额中抵扣。

企业所得税法实施条例条十九条：租金收入，按照合同约定的承租人应付租金的日期确认收入的实现。

　　国税函[2010]79号：一、关于租金收入确认问题根据《实施条例》第十九条的规定，企业提供固定资产、包装物或者其他有形资产的使用权取得的租金收入，应按交易合同或协议规定的承租人应付租金的日期确认收入的实现。其中，如果交易合同或协议中规定租赁期限跨年度，且租金提前一次性支付的，根据《实施条例》第九条规定的收入与费用配比原则，出租人可对上述已确认的收入，在租赁期内，分期均匀计入相关年度收入。

　　所以按合同约定收取的跨年度的租金收入，可以在收取一次确认收入，也可以在租赁期内分摊确认收入。

财税字[1995]52号《农业产品征税范围注释》：以粮食为原料加工的速冻食品、方便面、副食品和各种熟食品，不属于本货物的征税范围。

从会计的角度考虑，此处属于会计估计变更，多计提的折旧不用调整，在确认固定资产正确金额的时候，调整固定资产原值，并重新计算以后期间每月计提的折旧额。

　　从税务的角度分析，需要调整多计提的折旧，按照调整后的金额重新计提折旧，多计提的要冲掉。

一年以上的计入长期待摊费用，由于已经达到了1年，所以可以计入长期待摊费用，分期摊销进入各期销售费用或管理费用。

　　未超过1年的，计入预付账款，然后分期转入费用。

如果当地没有另行政策规范，则汽车应当视同销售确认。

　　贵公司应当确认增值税销项税额：

　　100000÷（1+17%）×17%.

　　确认企业所得税收入：

　　100000÷（1+17%）.

　　公司实际承担的代扣代缴个人所得税：

　　1000000÷（1-20%）×20%.

《财政部、国家税务总局关于廉租住房、经济适用住房和住房租赁有关税收政策的通知》（财税[2008]24号）第二条规定：

　　（一）对个人出租住房取得的所得减按10％的税率征收个人所得税。

　　（二）对个人出租、承租住房签订的租赁合同，免征印花税。

　　（三）对个人出租住房，不区分用途，在3％税率的基础上减半征收营业税，按4％的税率征收房产税，免征城镇土地使用税。

　　（四）对企事业单位、社会团体以及其他组织按市场价格向个人出租用于居住的住房，减按4％的税率征收房产税。

根据《国家税务总局关于企业工资薪金及职工福利费扣除问题的通知》（国税函[2009]3号）第三条规定，应当包括以下内容：

　　（一）尚未实行分离办社会职能的企业，其内设福利部门所发生的设备、设施和人员费用，包括职工食堂、职工浴室、理发室、医务所、托儿所、疗养院等集体福利部门的设备、设施及维修保养费用和福利部门工作人员的工资薪金、社会保险费、住房公积金、劳务费等。

　　（二）为职工卫生保健、生活、住房、交通等所发放的各项补贴和非货币性福利，包括企业向职工发放的因公外地就医费用、未实行医疗统筹企业职工医疗费用、职工供养直系亲属医疗补贴、供暖费补贴、职工防暑降温费、职工困难补贴、救济费、职工食堂经费补贴、职工交通补贴等。

　　（三）按照其他规定发生的其他职工福利费，包括丧葬补助费、抚恤费、安家费、探亲假路费等。

　　同时企业发生的职工福利费，应该单独设置账册，进行准确核算。没有单独设置账册准确核算的，税务机关应责令企业在规定的期限内进行改正。逾期仍未改正的，税务机关可对企业发生的职工福利费进行合理的核定。

这个应当遵循财政部发布的相关规定，具体参看《财政部关于企业加强职工福利费财务管理的通知》（财企[2009]242号）的如下规定：

　　企业职工福利费是指企业为职工提供的除职工工资、奖金、津贴、纳入工资总额管理的补贴、职工教育经费、社会保险费和补充养老保险费（年金）、补充医疗保险费及住房公积金以外的福利待遇支出，包括发放给职工或为职工支付的以下各项现金补贴和非货币性集体福利：

　　（一）为职工卫生保健、生活等发放或支付的各项现金补贴和非货币性福利，包括职工因公外地就医费用、暂未实行医疗统筹企业职工医疗费用、职工供养直系亲属医疗补贴、职工疗养费用、自办职工食堂经费补贴或未办职工食堂统一供应午餐支出、符合国家有关财务规定的供暖费补贴、防暑降温费等。

　　（二）企业尚未分离的内设集体福利部门所发生的设备、设施和人员费用，包括职工食堂、职工浴室、理发室、医务所、托儿所、疗养院、集体宿舍等集体福利部门设备、设施的折旧、维修保养费用以及集体福利部门工作人员的工资薪金、社会保险费、住房公积金、劳务费等人工费用。

　　（三）职工困难补助，或者企业统筹建立和管理的专门用于帮助、救济困难职工的基金支出。

　　（四）离退休人员统筹外费用，包括离休人员的医疗费及离退休人员其他统筹外费用。企业重组涉及的离退休人员统筹外费用，按照《财政部关于企业重组有关职工安置费用财务管理问题的通知》（财企[2009]117号）执行。国家另有规定的，从其规定。

　　（五）按规定发生的其他职工福利费，包括丧葬补助费、抚恤费、职工异地安家费、独生子女费、探亲假路费，以及符合企业职工福利费定义但没有包括在本通知各条款项目中的其他支出。

　　除以上项目外，还需注意企业给职工发放的节日补助、未统一供餐而按月发放的午餐费补贴，应当纳入工资总额管理。

《财政部 国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税2016年36号）附件3第五条规定，对于住房购买时间，应按照《国家税务总局 财政部 建设部关于加强房地产税收管理的通知》（国税发[2005]89号）和《国家税务总局关于房地产税收政策执行中几个具体问题的通知》（国税发〔2005〕172号）的有关规定执行，172号文规定个人购买住房以取得的房屋产权证或契税完税证明上注明的时间作为其购买房屋的时间。同时出具房屋产权证和契税完税证明且二者所注明的时间不一致的，按照"孰先"的原则确定购买房屋的时间。

《税收征管法》 第六十四条规定，纳税人不进行纳税申报，不缴或者少缴应纳税款的，由税务机关追缴其不缴或者少缴的税款、滞纳金，并处不缴或者少缴的税款百分之五十以上五倍以下的罚款。

　　因此，贵公司可能会被按照上述规定处罚，建议尽快补缴。