依据《企业会计准则第 16 号——政府补助》应用指南（2018）：“如果相关长期资产投入使用后企业再取得与资产相关的政府补助，净额法下应当在取得补助时冲减相关资产的账面价值，并按照冲减后的账面价值和相关资产的剩余使用寿命计提折旧或进行摊销。”

根据《吉林省地方税务局关于对财产与行为税有关业务问题的通知》（吉地税财行函[2001]23号）的规定：“《吉林省印花税征收管理办法》对买卖双方签定商品购销合同并核定征收印花税的单位及个人，其“购进金额”和“销售收入”的计税金额，均以购进商品付给对方的全部价款和销售商品收到对方的全部价款为计税依据。”

价款为不含增值税的销售额，所以签定商品购销合同并核定征收印花税的单位缴纳印花税的计税金额不含增值税。

依据《财政部、国家税务总局关于营改增后契税、房产税、土地增值税、个人所得税计税依据问题的通知》（财税〔2016〕43号）：“第二条规定，房产出租的，计征房产税的租金收入不含增值税。

第五条规定，免征增值税的，确定计税依据时，成交价格、租金收入、转让房地产取得的收入不扣减增值税额。”

根据上述规定，贵公司免征增值税，因此应当按照5万元作为租金收入缴纳房产税。

依据《个人所得税法》及其实施条例规定，个人取得工资、薪金所得应当缴纳个人所得税。工资、薪金所得，是指个人因任职或者受雇取得的工资、薪金、奖金、年终加薪、劳动分红、津贴、补贴以及与任职或者受雇有关的其他所得。个人所得的形式，包括现金、实物、有价证券和其他形式的经济利益；所得为其他形式的经济利益的，参照市场价格核定应纳税所得额。

免费给员工子女上课，属于员工取得了与任职或受雇相关的所得，因此，该教育机构需要按照市场价格核定应纳税所得额并入员工的正常工资薪金所得，扣缴申报员工的个人所得税。

根据《中华人民共和国契税暂行条例细则》的规定：“第八条土地、房屋权属以下列方式转移的，视同土地使用权转让、房屋买卖或者房屋赠与征税：……（二）以土地、房屋权属抵债……”

同时根据《契税暂行条例》的规定：“第四条 契税的计税依据：（一）国有土地使用权出让、土地使用权出售、房屋买卖，为成交价格；（二）土地使用权赠与、房屋赠与，由征收机关参照土地使用权出售、房屋买卖的市场价格核定；（三）土地使用权交换、房屋交换，为所交换的土地使用权、房屋的价格的差额。前款成交价格明显低于市场价格并且无正当理由的，或者所交换土地使用权、房屋的价格的差额明显不合理并且无正当理由的，由征收机关参照市场价格核定。”

依据上述政策，B公司取得抵债发购物应当缴纳契税，计税依据为抵债金额，如果抵债金额明显低于市场价格并且无正当理由的，由征收机关参照市场价格核定。 

根据《国家税务总局关于增值税一般纳税人登记管理办法》（国家税务总局令第43号）规定：“第八条 纳税人在年应税销售额超过规定标准的月份（或季度）的所属申报期结束后15日内按照本办法第六条或者第七条的规定办理相关手续；未按规定时限办理的，主管税务机关应当在规定时限结束后5日内制作《税务事项通知书》，告知纳税人应当在5日内向主管税务机关办理相关手续；逾期仍不办理的，次月起按销售额依照增值税税率计算应纳税额，不得抵扣进项税额，直至纳税人办理相关手续为止。

第九条 纳税人自一般纳税人生效之日起，按照增值税一般计税方法计算应纳税额，并可以按照规定领用增值税专用发票，财政部、国家税务总局另有规定的除外。

本办法所称的生效之日，是指纳税人办理登记的当月1日或者次月1日，由纳税人在办理登记手续时自行选择。”

2020年7月开发票超500万，则应该在10月15日内办理有关手续，2020年三季度仍然可以按照小规模纳税。 

依据《国家税务总局关于二手车经销等税收征收管理事项的公告》(2020年第9号)第二条第(一)款、第八条规定，自2020年5月1日起，纳税人受托对废弃物采取填埋、焚烧等方式进行专业化处理后未产生货物的，受托方属于提供《销售服务、无形资产、不动产注释》(财税〔2016〕36号文件印发)“现代服务”中的“专业技术服务”，其收取的处理费用适用6%的增值税税率。你公司处理污水后直接排入河流，未产生货物，按照上述规定，属于提供“专业技术服务”，收取的处理费用适用6%的增值税税率。

《财政部 国家税务总局关于印发的通知》(财税〔2015〕78号)规定，纳税人可以享受即征即退政策的综合利用的资源名称、综合利用产品和劳务名称、技术标准和相关条件、退税比例等要按照《资源综合利用产品和劳务增值税优惠目录》相关规定执行。因此，你公司提供的污水处理，如符合要求的技术标准和相关条件，可享受增值税即征即退70%政策。 

依据《国家税务总局关于母子公司间提供服务支付费用有关企业所得税处理问题的通知》（国税发[2008]86号）规定如下：“一、母公司为其子公司(以下简称子公司)提供各种服务而发生的费用，应按照独立企业之间公平交易原则确定服务的价格，作为企业正常的劳务费用进行税务处理。

母子公司未按照独立企业之间的业务往来收取价款的，税务机关有权予以调整。

二、母公司向其子公司提供各项服务，双方应签订服务合同或协议，明确规定提供服务的内容、收费标准及金额等，凡按上述合同或协议规定所发生的服务费，母公司应作为营业收入申报纳税;子公司作为成本费用在税前扣除。

……

五、子公司申报税前扣除向母公司支付的服务费用，应向主管税务机关提供与母公司签订的服务合同或者协议等与税前扣除该项费用相关的材料。不能提供相关材料的，支付的服务费用不得税前扣除。”

根据上述规定，母公司车辆提供给子公司使用，母公司应与子公司签订汽车租赁服务协议或合同收取租赁服务费，并给子公司开具发票，子公司依据租赁协议或合同、发票在税前扣除租赁费。而子公司使用车辆发生的汽车油费、过路过桥费可以在母公司税前扣除。 

依据《个人所得税法实施条例》第十四条的规定：“个人所得税法第六条第一款第二项、第四项、第六项所称每次，劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得，属于一次性收入的，以取得该项收入为一次；属于同一项目连续性收入的，以一个月内取得的收入为一次。”

依据 《个人所得税偷税案件查处中有关问题的补充通知》（国税函发1996年602号）第四条的规定：“考虑属地管辖与时间划定有交叉的特殊情况，统一法规以县（含县级市、区）为一地，其管辖内的一个月内的劳务服务为一次；当月跨县地域的，则应分别计算。”

因此，两个项目部跨县级地域，应该按照在两地分别代扣代缴个人所得税。待汇算清缴时，再行汇算清缴。

参考《中华人民共和国增值税暂行条例》

第十条 下列项目的进项税额不得从销项税额中抵扣：

（一）用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费的购进货物、劳务、服务、无形资产和不动产；

（二）非正常损失的购进货物，以及相关的劳务和交通运输服务；

（三）非正常损失的在产品、产成品所耗用的购进货物（不包括固定资产）、劳务和交通运输服务；

（四）国务院规定的其他项目。

根据上述规定，贵公司报废重新熔炼对应的增值税进项税额不需要做进项税转出处理。  

参考《中华人民共和国增值税暂行条例实施细则》第四条 单位或者个体工商户的下列行为，视同销售货物：（八）将自产、委托加工或者购进的货物无偿赠送其他单位或者个人。

财税[2016]36号文附件1 第二十七条规定， 下列项目的进项税额不得从销项税额中抵扣：（一）用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费的购进货物、加工修理修配劳务、服务、无形资产和不动产。

根据上述规定，贵公司按视同销售进行处理，赠送时按礼品的公允价计算“应交税费—增值税（销项税）”进项税无需转出。

参考（财税〔2016〕36号）附：销售服务、无形资产、不动产注释

第一条第五款：金融服务。金融服务，是指经营金融保险的业务活动。包括贷款服务、直接收费金融服务、保险服务和金融商品转让。

贷款服务。贷款，是指将资金贷与他人使用而取得利息收入的业务活动。

《中华人民共和国企业所得税法》第六条 企业以货币形式和非货币形式从各种来源取得的收入，为收入总额。包括：（五）利息收入；

根据上述规定，A公司是需要缴纳增值税及附加税、企业所得税。

财税【2016】36号 附件1：营业税改征增值税试点实施办法

第四十五条 增值税纳税义务、扣缴义务发生时间为：

第一款：纳税人发生应税行为并收讫销售款项或者取得索取销售款项凭据的当天；先开具发票的，为开具发票的当天。收讫销售款项，是指纳税人销售服务、无形资产、不动产过程中或者完成后收到款项。取得索取销售款项凭据的当天，是指书面合同确定的付款日期；未签订书面合同或者书面合同未确定付款日期的，为服务、无形资产转让完成的当天或者不动产权属变更的当天。

开具红字发票，请参考《国家税务总局关于红字增值税发票开具有关问题的公告》（国家税务总局公告2016年第47号）

（一）购买方取得专用发票已用于申报抵扣的，购买方可在增值税发票管理新系统（以下简称“新系统”）中填开并上传《开具红字增值税专用发票信息表》（以下简称《信息表》，详见附件），在填开《信息表》时不填写相对应的蓝字专用发票信息，应暂依《信息表》所列增值税税额从当期进项税额中转出，待取得销售方开具的红字专用发票后，与《信息表》一并作为记账凭证。购买方取得专用发票未用于申报抵扣、但发票联或抵扣联无法退回的，购买方填开《信息表》时应填写相对应的蓝字专用发票信息。销售方开具专用发票尚未交付购买方，以及购买方未用于申报抵扣并将发票联及抵扣联退回的，销售方可在新系统中填开并上传《信息表》。销售方填开《信息表》时应填写相对应的蓝字专用发票信息。

（二）主管税务机关通过网络接收纳税人上传的《信息表》，系统自动校验通过后，生成带有“红字发票信息表编号”的《信息表》，并将信息同步至纳税人端系统中。

（三）销售方凭税务机关系统校验通过的《信息表》开具红字专用发票，在新系统中以销项负数开具。红字专用发票应与《信息表》一一对应。

《中华人民共和国印花税暂行条例施行细则》

第十条 印花税只对税目税率表中列举的凭证和经财政部确定征税的其他凭证征税。

《中华人民共和国印花税暂行条例》

第二条 下列凭证为应纳税凭证：

第一款：购销、加工承揽、建设工程承包、财产租赁、货物运输、仓储保管、借款、财产保险、技术合同或者具有合同性质的凭证；

《建筑工程施工图设计文件审查合同》不属于印花税列举的范围，所以不交印花税。

《财政部 国家税务总局关于免征部分鲜活肉蛋产品流通环节增值税政策的通知》（财税〔2012〕75号）第一条：对从事农产品批发、零售的纳税人销售的部分鲜活肉蛋产品免征增值税。

《财政部 国家税务总局关于免征蔬菜流通环节增值税有关问题的通知》（财税〔2011〕137号）第一条：对从事蔬菜批发、零售的纳税人销售的蔬菜免征增值税。

参考 国家税务总局关于发布《纳税人跨县（市、区）提供建筑服务增值税征收管理暂行办法》的公告（国家税务总局公告2016年第17号）

第四条 纳税人跨县（市、区）提供建筑服务，按照以下规定预缴税款：

（一）一般纳税人跨县（市、区）提供建筑服务，适用一般计税方法计税的，以取得的全部价款和价外费用扣除支付的分包款后的余额，计算应预缴税款。

贵公司按一般计税项目在预缴增值税时可以扣除分包款，收到分包开具的增值税专用发票也是可以抵扣的。

参考《国家税务总局关于停止使用货物运输业增值税专用发票有关问题的公告》国家税务总局公告2015年第99号

第一条：增值税一般纳税人提供货物运输服务，使用增值税专用发票和增值税普通发票，开具发票时应将起运地、到达地、车种车号以及运输货物信息等内容填写在发票备注栏中，如内容较多可另附清单。

根据上述规定，开具运输发票时应将起运地、到达地、车种车号以及运输货物信息等内容填写在发票备注栏中，如内容较多可另附清单。

《财政部 国家税务总局关于出口货物劳务增值税和消费税政策的通知》（财税[2012]39号）第一条、适用增值税退（免）税政策的出口货物劳务

（二）出口企业或其他单位视同出口货物。具体是指：

2.出口企业经海关报关进入国家批准的出口加工区、保税物流园区、保税港区、综合保税区、珠澳跨境工业区（珠海园区）、中哈霍尔果斯国际边境合作中心（中方配套区域）、保税物流中心（B型）（以下统称特殊区域）并销售给特殊区域内单位或境外单位、个人的货物。

根据上述规定，您公司将生产的设备出售给天津综合保税区，可以享受出口退税政策。

回复：《中华人民共和国个人所得税法》（主席令第九号）第六条规定，应纳税所得额的计算：

（一）居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。

……

本条第一款第一项规定的专项扣除，包括居民个人按照国家规定的范围和标准缴纳的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险等社会保险费和住房公积金等；专项附加扣除，包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或者住房租金、赡养老人等支出，具体范围、标准和实施步骤由国务院确定，并报全国人民代表大会常务委员会备案。

根据上述规定可知，计算综合所得项目的个人所得税时可以扣除的项目不包括企业给员工购买的补充医疗保险中个人承担的部分。