两个公司之间借款，可以自己约定利息，但从税收角度，根据《实施条例》第三十八条规定，非金融企业向非金融企业借款的利息支出，不超过按照金融企业同期同类贷款利率计算的数额的部分，准予税前扣除。如为关联企业，根据财政部 国家税务总局《关于企业关联方利息支出税前扣除标准有关税收政策问题的通知》财税〔2008〕121号 规定，在计算应纳税所得额时，企业实际支付给关联方的利息支出，不超过以下规定比例和税法及其实施条例有关规定计算的部分，准予扣除，超过的部分不得在发生当期和以后年度扣除。
企业实际支付给关联方的利息支出，除符合本通知第二条规定外，其接受关联方债权性投资与其权益性投资比例为：
（一）金融企业，为5：1；
（二）其他企业，为2：1。
借款方付利息时，出借一方提增值税发票，及贷款协议，借款方据此在税前扣除。

根据财政部 国家税务总局《关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》财税〔2016〕36号十四条 下列情形视同销售服务、无形资产或者不动产：
（一）单位或者个体工商户向其他单位或者个人无偿提供服务，但用于公益事业或者以社会公众为对象的除外。
因此，股东向公司借款是否付利息由双方约定，即使无偿借款公司按规定缴纳增值税。如果付息股东个人到税务机关代开“贷款服务”增值税普通发票。

根据国家税务总局《关于明确中外合作办学等若干增值税征管问题的公告 》 国家税务总局公告2018年第42号 规定，一般纳税人销售自产机器设备的同时提供安装服务，应分别核算机器设备和安装服务的销售额，安装服务可以按照甲供工程选择适用简易计税方法计税。一般纳税人销售外购机器设备的同时提供安装服务，如果已经按照兼营的有关规定，分别核算机器设备和安装服务的销售额，安装服务可以按照甲供工程选择适用简易计税方法计税。纳税人对安装运行后的机器设备提供的维护保养服务，按照“其他现代服务”缴纳增值税。
因此，贵公司销售自产机器设备的同时提供安装服务，应分别核算机器设备和安装服务的销售额，安装服务可以按照甲供工程选择适用简易计税方法计税，即征收率3%；销售外购机器设备的同时提供安装服务，如果已经按照兼营的有关规定，分别核算机器设备和安装服务的销售额，安装服务可以按照甲供工程选择适用简易计税方法计税，否则按混合销售，安装公司按9%；商业批发零售按13%。

根据国税总局关于发布《企业所得税税前扣除凭证管理办法》的公告 国家税务总局公告2018年第28号
第十四条
企业在补开、换开发票、其他外部凭证过程中，因对方注销、撤销、依法被吊销营业执照、被税务机关认定为非正常户等特殊原因无法补开、换开发票、其他外部凭证的，可凭以下资料证实支出真实性后，其支出允许税前扣除：
（一）无法补开、换开发票、其他外部凭证原因的证明资料（包括工商注销、机构撤销、列入非正常经营户、破产公告等证明资料）；
（二）相关业务活动的合同或者协议；
（三）采用非现金方式支付的付款凭证； （并非现金支付不能抵扣）
（四）货物运输的证明资料；
（五）货物入库、出库内部凭证；
（六）企业会计核算记录以及其他资料。
前款第一项至第三项为必备资料。

对方注销的，使用在工商信用网站上查找的注销记录以及相关采购合同以及非现金付款记录即可。

按照会计差错处理
借：以前年度损益调整
贷：应付账款
 
借：利润分配—未分配利润-期初
贷：以前年度损益调整

借：长期待摊费用
贷：应付账款
摊销年限为剩余租赁期限。
 
根据《企业所得税法》第十三条规定：在计算应纳税所得额时，企业发生的下列支出作为长期待摊费用，按照规定摊销的，准予扣除：
（一）已足额提取折旧的固定资产的改建支出；
（二）租入固定资产的改建支出；
（三）固定资产的大修理支出；
（四）其他应当作为长期待摊费用的支出。
《企业所得税法实施条例》第六十八条规定：企业所得税法第十三条第（一）项和第（二）项所称固定资产的改建支出，是指改变房屋或者建筑物结构、延长使用年限等发生的支出。
企业所得税法第十三条第（一）项规定的支出，按照固定资产预计尚可使用年限分期摊销；第（二）项规定的支出，按照合同约定的剩余租赁期限分期摊销。（剩余租期）

根据《国家税务总局关于纳税人对外开具增值税专用发票有关问题的公告》（国家税务总局公告2014年第39号）  现将纳税人对外开具增值税专用发票有关问题公告如下：
纳税人通过虚增增值税进项税额偷逃税款，但对外开具增值税专用发票同时符合以下情形的，不属于对外虚开增值税专用发票：
一、纳税人向受票方纳税人销售了货物，或者提供了增值税应税劳务、应税服务；
二、纳税人向受票方纳税人收取了所销售货物、所提供应税劳务或者应税服务的款项，或者取得了索取销售款项的凭据；
三、纳税人按规定向受票方纳税人开具的增值税专用发票相关内容，与所销售货物、所提供应税劳务或者应税服务相符，且该增值税专用发票是纳税人合法取得、并以自己名义开具的。

其中第二项索取销售款项的凭据是指合同，所以几项应税行为之间存在债权债务转让时，需要添加新合同条款或者签订新合同。
并且原有应税服务要按照合同约定价款而不是结算价款进行开票以及申报。

根据财政部 税务总局 海关总署公告2019年第39号
七、自2019年4月1日至2021年12月31日，允许生产、生活性服务业纳税人按照当期可抵扣进项税额加计10%，抵减应纳税额（以下称加计抵减政策）。
（一）本公告所称生产、生活性服务业纳税人，是指提供邮政服务、电信服务、现代服务、生活服务（以下称四项服务）取得的销售额占全部销售额的比重超过50%的纳税人。四项服务的具体范围按照《销售服务、无形资产、不动产注释》（财税〔2016〕36号印发）执行。
 
贵公司提供担保属于金融服务，不属于加计抵减行业范围。

根据《车辆购置税法》
第十一条 纳税人购置应税车辆，应当向车辆登记地的主管税务机关申报缴纳车辆购置税；购置不需要办理车辆登记的应税车辆的，应当向纳税人所在地的主管税务机关申报缴纳车辆购置税。
贵公司需要执行申报车辆购置税。

根据《个人所得税法》
第四条 下列各项个人所得，免征个人所得税：
七、按照国家统一规定发给干部、职工的安家费、退职费、基本养老金或者退休费、离休费、离休生活补助费；
 
所以该项所得免征个人所得税。

根据国家税务总局公告2014年第67号 国家税务总局关于发布《股权转让所得个人所得税管理办法（试行）》的公告
第五条 个人股权转让所得个人所得税，以股权转让方为纳税人，以受让方为扣缴义务人。
第七条 股权转让收入是指转让方因股权转让而获得的现金、实物、有价证券和其他形式的经济利益。
第八条 转让方取得与股权转让相关的各种款项，包括违约金、补偿金以及其他名目的款项、资产、权益等，均应当并入股权转让收入。
第十五条 个人转让股权的原值依照以下方法确认：
（一）以现金出资方式取得的股权，按照实际支付的价款与取得股权直接相关的合理税费之和确认股权原值；
（二）以非货币性资产出资方式取得的股权，按照税务机关认可或核定的投资入股时非货币性资产价格与取得股权直接相关的合理税费之和确认股权原值；
（三）通过无偿让渡方式取得股权，具备本办法第十三条第二项所列情形的，按取得股权发生的合理税费与原持有人的股权原值之和确认股权原值；
（四）被投资企业以资本公积、盈余公积、未分配利润转增股本，个人股东已依法缴纳个人所得税的，以转增额和相关税费之和确认其新转增股本的股权原值；
（五）除以上情形外，由主管税务机关按照避免重复征收个人所得税的原则合理确认股权原值。
 
股权转让所得=收入-股权原值
 
股权原值按照实际出资确定，与认缴没有直接关系。

会计折旧正常安装预计可使用年限进行计提，不能一次性计入费用。
所得税可以选择一次性税前扣除。
每季度（月）预缴时 在A201020 固定资产加速折旧(扣除)优惠明细表进行调整。
汇算清缴时在A105080资产折旧、摊销及纳税调整明细表 进行纳税调整。
 
根据财税[2018]54号 财政部 税务总局关于设备、器具扣除有关企业所得税政策的通知
一、企业在2018年1月1日至2020年12月31日期间新购进的设备、器具，单位价值不超过500万元的，允许一次性计入当期成本费用在计算应纳税所得额时扣除，不再分年度计算折旧；单位价值超过500万元的，仍按企业所得税法实施条例、《财政部 国家税务总局关于完善固定资产加速折旧企业所得税政策的通知》（财税〔2014〕75号）、《财政部 国家税务总局关于进一步完善固定资产加速折旧企业所得税政策的通知》（财税〔2015〕106号）等相关规定执行。
二、本通知所称设备、器具，是指除房屋、建筑物以外的固定资产。

根据财政部 国家税务总局《关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》财税〔2016〕36号
附件销售服务、无形资产、不动产注释
仓储服务，是指利用仓库、货场或者其他场所代客贮放、保管货物的业务活动。
经营租赁服务，是指在约定时间内将有形动产或者不动产转让他人使用且租赁物所有权不变更的业务活动。
按照标的物的不同，经营租赁服务可分为有形动产经营租赁服务和不动产经营租赁服务。
 
仓储服务需要对客户的货物进行妥善保管，合同义务为保管货物，不是简单的提供场地。
出租不动产是，把仓库出租给客户，客户想怎么用怎么用，其货物存储情况与贵公司无关。
 
开票项目需要根据开票系统中项目类别进行选择，商品服务分类代码没有仓储租赁这一项。
 
贵公司业务属于出租不动产的，征收率应为5%。

非全日制用工是劳动合同法口径，个人所得税没有这个东西。
如果是确定关系非全日制用工人员的，其取得收入按照工资薪金所得处理。可以在汇缴时扣除6万以及专项扣除、专项附加扣除。
根据中华人民共和国个人所得税法
第二条 下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税。
第六条 应纳税所得额的计算：
（一）居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。
 
月度扣缴时按照下列规定执行。
根据国家税务总局关于发布《个人所得税扣缴申报管理办法（试行）》的公告（国家税务总局公告2018年第61号）
第六条 扣缴义务人向居民个人支付工资、薪金所得时，应当按照累计预扣法计算预扣税款，并按月办理扣缴申报。
累计预扣法，是指扣缴义务人在一个纳税年度内预扣预缴税款时，以纳税人在本单位截至当前月份工资、薪金所得累计收入减除累计免税收入、累计减除费用、累计专项扣除、累计专项附加扣除和累计依法确定的其他扣除后的余额为累计预扣预缴应纳税所得额，适用个人所得税预扣率表一（见附件），计算累计应预扣预缴税额，再减除累计减免税额和累计已预扣预缴税额，其余额为本期应预扣预缴税额。余额为负值时，暂不退税。纳税年度终了后余额仍为负值时，由纳税人通过办理综合所得年度汇算清缴，税款多退少补。
具体计算公式如下：
本期应预扣预缴税额=（累计预扣预缴应纳税所得额×预扣率-速算扣除数)-累计减免税额-累计已预扣预缴税额
累计预扣预缴应纳税所得额=累计收入-累计免税收入-累计减除费用-累计专项扣除-累计专项附加扣除-累计依法确定的其他扣除
其中：累计减除费用，按照5000元/月乘以纳税人当年截至本月在本单位的任职受雇月份数计算。

根据中华人民共和国发票管理办法实施细则
第四条发票的基本内容包括：。。。。开票人、开票日期、开票单位(个人)名称(章)等。
 
政策层面没有对收款人和复核人有强制性要求，影响发票效力。

根据财政部 税务总局 海关总署公告2019年第39号
一、增值税一般纳税人（以下称纳税人）发生增值税应税销售行为或者进口货物，原适用16%税率的，税率调整为13%；原适用10%税率的，税率调整为9%。
二、纳税人购进农产品，原适用10%扣除率的，扣除率调整为9%。纳税人购进用于生产或者委托加工13%税率货物的农产品，按照10%的扣除率计算进项税额。
 
贵公司情况扣除率为9%。
 
根据财税字[1995]52号 财政部、国家税务总局关于印发《农业产品征税范围注释》的通知
（一）粮食
粮食是指各种主食食科植物果实的总称。本货物的征税范围包括小麦，稻谷，玉米，高粱，谷子和其他杂粮（如：大麦，燕麦等），以及经碾磨、脱壳等工艺加工后的粮食（如：面粉、米、玉米面、渣等）
切面、饺子皮、馄饨皮、面皮、米粉等粮食复制品，也属于本货物的征税范围。
以粮食为原料加工的速冻食品、方便面、副食品和各种熟食品，不属于本货物的征税范围。

贵公司把大米经过包装，有密封袋的和礼盒包装进行销售，没有进行加工销售的依然是大米，属于农产品项目。
销售非自产农产品，税率为9%。

根据国家税务总局关于发布《个人所得税扣缴申报管理办法（试行）》的公告（国家税务总局公告2018年第61号）
第六条 扣缴义务人向居民个人支付工资、薪金所得时，应当按照累计预扣法计算预扣税款，并按月办理扣缴申报。所以个人所得税是站在员工角度按照公司实际支付也就是个人实际收取发生纳税义务。
所以贵公司分别发放奖金，相当于一次性奖金事项发生了两次，但全年一次奖事项只能一个纳税年度只能适用一次。
严格来讲贵公司不能将两次奖金合并申报。
 
贵公司想要更正申报的，只能拿着对应期间的工资表和银行代发记录到大厅进行更正申报。
但是银行代发记录为两个月分次发放，个人认为更正申报有困难。

计入财务费用—利息收入。

从规定上公司整体包括总公司和分公司，是独立的所得税纳税人，享受所得税优惠需要将总分公司相关指标加总计算。
且根据，国税总局2012年第57号公告 《跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理办法》
第五条  以下二级分支机构不就地分摊缴纳企业所得税：
（二）上年度认定为小型微利企业的其二级分支机构不就地分摊缴纳企业所得税。
小微企业的分支机构不实行总分机构汇总纳税就地分摊办法，全部回到总机构缴纳。
 
但实际操作中，申报时不选择总分机构选项不填写总分机构信息的，都视为独立纳税人进行处理。系统逻辑上，单独适用税收优惠条件。
 
也就是说，贵公司总分机构分别适用税收优惠的，不符合税务规定，但可以在系统上实现。但有税务风险。

公司社保登记各地要求不一，确实有地区要求公司社保账户最低参保人数不小于3人这个说法。
该问题没有国家层次规定，还请遵循地方口径。