《财政部 国家税务总局关于营改增后契税 房产税 土地增值税 个人所得税 计税依据问题的通知》（财税〔2016〕43号）第六条规定，自2016年5月1日起，营业税改征增值税后契税、房产税、土地增值税、个人所得税的计税依据，税务机关核定的计税价格或收入不含增值税。

根据上述规定，核定征收个税的个体工商户计算个税的收入是不含增值税收入。