答：房地产企业工程竣工验收后，根据合同约定，扣留建筑安装施工企业一定比例工程款，作项目质量保证金。计算土地增值税时，施工企业就质量保证金对房地产企业开发票的，开发企业按发票所载金额予以扣除；未开发票的，开发企业扣留质保金不得计算扣除。(国税函[2010]220号)

注意：

土地增值税与企业所得税不同。国税发[2009]31号规定，计算企业所得税时，出包工程未最终办理结算而未取得全额发票的，在证明资料充分前提下，其发票不足金额可预提，但最高不得超过合同总金额10％。