按照《税收征收管理法》第六十九条规定：扣缴义务人应扣未扣、应收而不收税款的，由税务机关向纳税人追缴税款，对扣缴义务人处应扣未扣、应收未收税款百分之五十以上三倍以下的罚款。

　　而《国家税务总局关于贯彻〈中华人民共和国税收征收管理法〉及其实施细则若干具体问题的通知》(国税发〔2003〕47号)第二项关于扣缴义务人扣缴税款问题规定：扣缴义务人违反征管法及其实施细则规定应扣未扣、应收未收税款的，税务机关除按征管法及其实施细则的有关规定对其给予处罚外，应当责成扣缴义务人限期将应扣未扣、应收未收的税款补扣或补收。

　　到底是由税务机关追缴，还是由扣缴义务人补扣?

　　笔者认为，《征管法》规定的本意是，扣缴义务人只有依法履行代扣代缴、代收代缴税款之责任，却没有缴纳税款之义务。相应税款的征纳关系并没有改变，收款人是纳税人，税务机关是征税人，而征税的方式是代扣代缴。部分网友认为，国税发〔2003〕47号的规定与《征管法》“由税务机关向纳税人追缴税款”的规定相抵触，有一定道理。然而，从防范风险角度来说，扣缴义务人还是要配合税务机关，履行好代扣代缴的义务。

　　在《上海市税务行政处罚裁量基准》中，有如下规定：

　　四、违反税款征收管理类

　　(五)扣缴义务人应扣未扣、应收而不收税款的(纳税人拒绝代扣、代收税款，扣缴义务人已按规定暂停支付纳税人款项并向税务机关报告的除外)。

　　情节程度及处罚标准：

　　1.扣缴义务人能够按规定补扣补收税款的，处以应扣未扣、应收未收税款百分之五十以上二倍以下的罚款;

　　2.扣缴义务人未能按规定补扣补收税款的，税务机关在追缴税款的同时，对扣缴义务人处以应扣未扣、应收未收税款二倍以上三倍以下的罚款。

　　可见，积极配合税务机关补扣补缴，有利于于避免遭受更大金额罚款。

根据《税收征管法》第五十二条　因税务机关的责任，致使纳税人、扣缴义务人未缴或者少缴税款的，税务机关在三年内可以要求纳税人、扣缴义务人补缴税款，但是不得加收滞纳金。

因纳税人、扣缴义务人计算错误等失误，未缴或者少缴税款的，税务机关在三年内可以追征税款、滞纳金;有特殊情况的，追征期可以延长到五年。

对偷税、抗税、骗税的，税务机关追征其未缴或者少缴的税款、滞纳金或者所骗取的税款，不受前款法规期限的限制。

以及《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》（国务院令〔2002〕362号）第八十一条规定，税收征管法第五十二条所称纳税人、扣缴义务人计算错误等失误，是指非主观故意的计算公式运用错误以及明显的笔误。

    第八十二条规定， 税收征管法第五十二条所称特殊情况，是指纳税人或者扣缴义务人因计算错误等失误，未缴或者少缴、未扣或者少扣、未收或者少收税款，累计数额在10万元以上的。

     根据以上规定，纳税人非主观故意的计算公式运用错误以及明显的笔误导致计算错误等失误，从而少缴税款10万元以下的，税款追征期为3年，数额10万元以上的，追征期为5年。

如果贵公司是因为计算错误等失误，未缴或者少缴税款的，可以按照5年期限不再追缴处理。但是如果贵公司该事项涉及到违规操作金额偷税漏税的，税务机关可以无限期追缴税款。